Одной из сторон деятельности ЦГМ РК является его непосредственное участие в создании новых музеев как по республике, так и за его пределами. За последнее десятилетие Музей разработал научные концепции и осуществил строительство экспозиций нескольких музеев, в т.ч. Президентского центра культуры в Астане, Музея политических репрессий, мемориальных музеев Казахского государственного женского университета, СШ № 12, Г. и А. Жубановых в Алматы, музеев МВД и Верховного Суда Республики Казахстан в Астане, а также принимал участие в создании Музея Курмангазы Сагырбаева в Астраханской области РФ.

В новой столице Республики Казахстан – Астане с 1999 года началось строительство крупнейшего культурного учреждения страны – Президентского Центра культуры, в состав которого вошли музей и библиотека. Следует отметить, что научная концепция нового Музея, объемом свыше 150 страниц, разработанная Нурсаном Алимбаем получила высокую оценку   научной общественности и была реализована при создании экспозиционных комплексов   музея Президентского центра культуры РК. За короткий срок, под руководством Нурсана Алимбая был укомплектован штат в 350 человек, организованы собирательские историко-этнографические экспедиции по всей стране и, несмотря на все трудности и спешный порядок работы, экспозиции Музея и сам Президентский центр культуры были открыты, став одним из первых крупнейших культурных учреждений и архитектурной достопримечательностью новой столицы.

В 2001 г. в Алматы открывается, по инициативе фонда «Адилет» и при поддержке президента Республики Казахстан Н.А. Назарбаева, филиал ЦГМ РК – Музей политических репрессий. Научная концепция музея была разработана Нурсаном Алимбаем. Экспозиции музея, посвященные трагическим годам сталинских репрессий и людям, попавшим в жернова тоталитарной системы, были построены в историческом здании, где в 30-е годы находилось НКВД, а затем КГБ республики (на пересечении улиц Кабанбай батыра и Наурызбай батыра). В экспозиции нашли отражение истории судеб представителей казахской интеллигенции, общественных деятелей, подвергшихся практически тотальному уничтожению. Построение экспозиции и открытие Музея истории политических репрессий знаменовало собой новый этап в восполнении белых пятен истории Казахстана. К сожалению, после открытия Музей истории политических репрессий, созданный усилиями творческого коллектива ЦГМ РК, по непонятным причинам был ликвидирован, экспонаты переданы в ведение Музея истории города Алматы, а здание отошло Альянс банку.

29 апреля 2006 г. состоялось открытие филиала ЦГМ РК — мемориального музея-квартиры Ахмета и Газизы Жубановых — композиторов, народных артистов Казахской ССР и СССР. Создание нового музея было полностью осуществлено (ремонт квартиры, формирование фондовой коллекции, разработка концепции, тематико-экспозиционного плана и построение собственно экспозиции), сотрудниками ЦГМ РК.

Очень важной частью научной деятельности музея являются научно-археологические реконструкции. В последние годы Музеем предприняты проекты, посвященные воссозданию научно обоснованных, археологически достоверных синкретических собирательных образов древних насельников Казахстана. Реконструкции синтезирует в себе многолетние научные разработки в области археологической реконструкции культуры ранних раннего железа в Евразии. В таком качестве выступают достаточно репрезентативно и служат источником информации о различных аспектах культуры, традиций конных номадов – основных носителей раннекочевнической цивилизации и по своей концептуальной основе, целям и задачам соответствуют музейному назначению. Так были успешно реализованы археологические проекты по научной реконструкции: «Кангюйская женщина II в. до н.э.-IV в. н.э.», «Вооружение и одежда знатного воина – сюнну (гунна) II в. до н.э. – I в.н.э.» (автор А.Н.Подушкин); новая реконструкция «Золотого человека» IV-III вв. до н.э. (по новой научной интерпретации Алишера Акишева изготовил К. Алтынбеков). Антропологические скульптурные реконструкции мужчины и женщины из могильника Алтын-Асар (автор реконструкции Г.С.Балуева). Антропологическая скульптурная реконструкция мужчины из городища Томпак-Асар (автор реконструкции Е.Веселовская). «Костюм женщины эпохи бронзы, андроновская культура. XVII-XII вв. до н.э.» (реконструкция А. Акишева). Материалы, переданные Нурсаном Алимбаем: антропологическая скульптурная реконструкция мужчины со стоянки Кос-Кудук эпохи неолита — V тыс. до н.э. (автор реконструкции Е.Веселовская, раскопки А.Е. Астафьева и З.С. Самашева, Западный Казахстан).

В 2014 г. по заданию Министерства культуры РК ЦГМ РК разработаны два проекта при непосредственном участии и руководстве директора музея – Нурсан Алимбая:

– проект историко-этнографического комплекса «Қазақ ауылы» на территории международной выставки «ЭКСПО-2017» в г. Астане, как одного из органических (структурных) составляющих этого поистине грандиозного международного мероприятия. Организация историко-этнографического комплекса «Қазақ ауылы» в соответствии со структурно-функциональными компонентами традиционной системы жизнеобеспечения казахов позволит достаточно эффективно демонстрировать эстетику и разнохарактерные жизнеобеспечивающие функции многовековой культурно-этнической традиции казахов.

Научно обоснованный, максимально приближенный к своему историко-этнографическому (онтологическому) прототипу такой комплекс будет демонстрировать посетителям мобилизующий дух традиции потомков носителей многовековой культуры конных номадов. Предстоящая выставка «ЭКСПО-2017» безусловно, послужит еще одним мощным фактором дальнейшего возрастания интереса зарубежных стран к нашему по историческим меркам совсем молодому государству:

– проект экспозиции зала этнографии Национального Музея Республики Казахстан (авторский проект Нурсан Алимбая). Проектом предусматривалось размещение экспозиции связанной с казахской этнографией в одном из залов здания Национального музея. Так как размещение экспозиции ограничивалось габаритами выделенной площади, экспозиционное пространство зала было зонировано в три взаимосвязанных и взаимозависимых сегмента: а) по левой стороне от основного входа в зал должны размещаться разнохарактерные предметы домашнего хозяйства и быта кочевников; б) по правой – предметы традиционной скотоводческой и земледельческой деятельности казахов; в) по центру – предлагались два варианта: комплекс «казахский традиционный парадный костюм» и комплекс «проводы невесты». Реализация проекта на месте была осуществлена усилиями научных сотрудников ЦГМ РК под непосредственным руководством самого автора. Все работы по размещению и установке экспозиционных комплексов, дизайнерские разработки, разработки науных текстов и этикетажа этнографического зала Национального музея РК были выполнены силами научных сотрудников и художников-экспозиционеров Центрального государственного музея.